加工貿(mào)易保稅貨物深加工結(jié)轉(zhuǎn)：是指加工貿(mào)易企業(yè)將保稅料件加工的產(chǎn)品轉(zhuǎn)至另一個加工貿(mào)易企業(yè)進一步加工后復(fù)出口的經(jīng)營活動。
加工貿(mào)易保稅貨物深加工結(jié)轉(zhuǎn)的程序要經(jīng)過三個環(huán)節(jié)：
計劃備案(計劃申報)
收發(fā)貨登記
結(jié)轉(zhuǎn)報關(guān)(辦理報關(guān)手續(xù))
(1)第一個環(huán)節(jié)：計劃備案(計劃申報)
轉(zhuǎn)出企業(yè)、轉(zhuǎn)入企業(yè)向各自的主管海關(guān)提交加工貿(mào)易保稅貨物深加工結(jié)轉(zhuǎn)申請表，申報結(jié)轉(zhuǎn)計劃。
①轉(zhuǎn)出企業(yè)填寫申報表(一式四聯(lián))、簽章，向轉(zhuǎn)出地海關(guān)備案；
②轉(zhuǎn)出地海關(guān)備案后，留存一聯(lián)，其余三聯(lián)退轉(zhuǎn)出企業(yè) 交 轉(zhuǎn)入企業(yè)
③轉(zhuǎn)入企業(yè)在轉(zhuǎn)出企業(yè)備案后20日內(nèi)，持申請表的其余三聯(lián)，填寫本企業(yè)相關(guān)內(nèi)容后簽章，向轉(zhuǎn)入地海關(guān)備案；
④轉(zhuǎn)入地海關(guān)審核后，將申請表第二聯(lián)留存，第三聯(lián)和第四聯(lián)交轉(zhuǎn)入、轉(zhuǎn)出企業(yè)憑以辦理結(jié)轉(zhuǎn)收發(fā)貨登記及報關(guān)手續(xù)。
★在計劃備案節(jié)：先是轉(zhuǎn)出企業(yè)辦理轉(zhuǎn)出備案，后是轉(zhuǎn)入企業(yè)辦理轉(zhuǎn)入備案
深加工結(jié)轉(zhuǎn)，在計劃備案這個環(huán)節(jié)中，先是轉(zhuǎn)出企業(yè)辦理，后是轉(zhuǎn)入企業(yè)辦理。
(2)收發(fā)貨登記
轉(zhuǎn)出、轉(zhuǎn)入企業(yè)在海關(guān)備案申請保稅貨物深加工結(jié)轉(zhuǎn)后，應(yīng)該按照海關(guān)核準(zhǔn)的計劃進行實際發(fā)貨，并在實際結(jié)轉(zhuǎn)情況登記表上如實登記，并加蓋企業(yè)結(jié)轉(zhuǎn)專用章。
(3)結(jié)轉(zhuǎn)報關(guān)
轉(zhuǎn)出、轉(zhuǎn)入企業(yè)實際收發(fā)貨后，應(yīng)當(dāng)按照規(guī)定辦理結(jié)轉(zhuǎn)報關(guān)手續(xù)。
①、轉(zhuǎn)出、轉(zhuǎn)入企業(yè)應(yīng)當(dāng)分別在轉(zhuǎn)出地、轉(zhuǎn)入地海關(guān)辦理結(jié)轉(zhuǎn)報關(guān)手續(xù)；
轉(zhuǎn)出、轉(zhuǎn)入企業(yè)可以憑一份《申請表》分批或者集中辦理報關(guān)手續(xù)；
轉(zhuǎn)出(入)企業(yè)每批實際發(fā)(收)貨后，應(yīng)當(dāng)在90日內(nèi)辦結(jié)該批貨物的報關(guān)手續(xù)；
具體的做法：
②、轉(zhuǎn)入企業(yè)憑《申請表》、《登記表》等單證向轉(zhuǎn)入地海關(guān)辦理結(jié)轉(zhuǎn)進口報關(guān)手續(xù)，并在結(jié)轉(zhuǎn)進口報關(guān)后的第二個工作日內(nèi)將報關(guān)情況通知轉(zhuǎn)出企業(yè)；
③、轉(zhuǎn)出企業(yè)自接到轉(zhuǎn)入企業(yè)通知之日起10日內(nèi)，憑《申請表》、登記表》等單證向轉(zhuǎn)出地海關(guān)辦理結(jié)轉(zhuǎn)出口報關(guān)手續(xù)；
★(從② ③ 得知，在結(jié)轉(zhuǎn)報關(guān)環(huán)節(jié)：轉(zhuǎn)入企業(yè)先報關(guān)，轉(zhuǎn)出企業(yè)后報關(guān))
④結(jié)轉(zhuǎn)進口、出口報關(guān)的申報價格為結(jié)轉(zhuǎn)貨物的實際成交價格；
⑤一份結(jié)轉(zhuǎn)進口報關(guān)單對應(yīng)一份結(jié)轉(zhuǎn)出口報關(guān)單，兩份報關(guān)單之間對應(yīng)的申報序號、商品編號、數(shù)量、價格和手冊號應(yīng)當(dāng)一致；
⑥結(jié)轉(zhuǎn)貨物分批報關(guān)的，企業(yè)應(yīng)當(dāng)同時提供《申請表》和《登記表》的原件及復(fù)印件；
深加工結(jié)轉(zhuǎn)要注意：
※深加工結(jié)轉(zhuǎn)的程序是：先計劃申報；再辦理收發(fā)貨登記；最后辦理報關(guān)手續(xù)。
※在計劃申報中：先轉(zhuǎn)出企業(yè)辦理，后轉(zhuǎn)入企業(yè)辦理；
※在辦理報關(guān)手續(xù)中：先轉(zhuǎn)入企業(yè)辦理，后轉(zhuǎn)出企業(yè)辦理。
紙質(zhì)手冊深加工結(jié)轉(zhuǎn)在計劃備案階段和結(jié)轉(zhuǎn)報關(guān)階段都是向各自海關(guān)辦理。
跨關(guān)區(qū)異地加工、加工貿(mào)易外發(fā)加工、加工貿(mào)易保稅貨物深加工結(jié)轉(zhuǎn)區(qū)別：
(1)跨關(guān)區(qū)異地加工材料直接運到關(guān)區(qū)以外的其他企業(yè)進行加工。
(2)加工貿(mào)易外發(fā)加工，是將加工的個別工序，委托別的企業(yè)進行加工。
(3)加工貿(mào)易保稅貨物深加工結(jié)轉(zhuǎn)：將料件在自己的關(guān)區(qū)內(nèi)已經(jīng)完成了加工，然后，轉(zhuǎn)到另外一個關(guān)區(qū)進行進一步的加工。