進口貨物進入保稅倉庫有兩種情況：一種是直接由保稅倉庫所在地口岸入境；另一種在保稅倉庫以外的其它口岸入境。
（1）由保稅倉庫所在地口岸入境
向海關(guān)申報時，須填寫進口貨物報關(guān)單，并在報關(guān)單上加蓋保稅倉庫貨物標簽，同時注明存入××保稅倉庫，經(jīng)海關(guān)查驗后始可將貨物存入保稅倉庫。
（2）由保稅倉庫以外的口岸入境
向海關(guān)申報時，需按海關(guān)進口貨物轉(zhuǎn)關(guān)運輸管理規(guī)定辦理轉(zhuǎn)關(guān)運輸手續(xù)。
其具體做法由貨物所有人先向保稅倉庫所在地主管海關(guān)提出將進口貨物轉(zhuǎn)運至保稅倉庫的申請，主管海關(guān)核實后，簽發(fā)進口貨物轉(zhuǎn)關(guān)運輸聯(lián)系單，并注明貨物轉(zhuǎn)運入××保稅倉庫。
其次，由貨物所有人持此聯(lián)系單到入境地海關(guān)辦理轉(zhuǎn)關(guān)運輸手續(xù)，入境地海關(guān)核準后，將進口貨物監(jiān)管運至保稅倉庫所在地。貨物抵達保稅倉庫后，貨物所有人依上述（1）“由保稅倉庫所在地口岸入境”之規(guī)定向主管海關(guān)辦理進口貨物申報及入庫手續(xù)。